A farmacogenômica  trata da influencia dos fatores genéticos sobre a resposta aos medicamentos. O câncer de mama é uma doença heterogênea, com variações genéticas que afetam a tumorigênese e a progressão tumoral. Tais variações têm sido exploradas, a fim de permitir uma terapia mais direcionadas e eficaz. Além disso, alguns pacientes desenvolvem resistência aos medicamentos ou efeitos tóxicos que limitam a efetividade terapêutica. A identificação das causas individuais para as reações adversas ou para a resistência ao tratamento é objetivo de estudos farmacogenéticos. Uma das terapias utilizadas é a terapia hormonal. 

Terapia Hormonal foi o primeiro grande avanço em busca da terapia individualizada do câncer de mama foi a possibilidade de identificação dos receptores de estrógeno (ER) e de progesterona (PR). Os tumores positivos para ER, cujo crescimento depende de estímulos hormonal, são eficazmente tratados com terapia antiestrogênio, seja pelo uso de antagonistas do ER, como o tamoxifeno, ou pela inibição da síntese endógena, como inibidores da aromatose, tais como: anastrozol e letrozol. Os tumores negativos para ER não apresentam proliferação dependente de estrogênio e, portanto, não apresentam indicação para terapia com tamoxifeno ou com inibidores de aromatase. Por outro lado, tais tumores são mais sensíveis as combinações de quimioterápicos de primeira linha, envolvendo antraciclinas e taxanos. Outro marcador tumoral bem caracterizado é o Receptor do Fator de Crescimento Epidérmico 2 Humano (HER2). O HER2 foi identificado como um marcador de pior prognóstico e de maior agressividade do câncer.

http://www.inca.gov.br/rbc/n_59/v03/pdf/15-artigoopiniao-farmacogenetica-implicacoes-terapeuticas-cancer-mama.pdf